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En algunos municipios cafeteros de los departamentos de Caldas y Risaralda, en la Zona Central de Colombia, los cultivos de café se encuentran en riesgo asociado a variaciones climáticas extremas. Con el fin de evaluar las relaciones entre los cambios en los sistemas de producción y las variaciones de los elementos biofísicos, se recopiló información de todas las fincas cafeteras ubicadas en los municipios de Santuario y Balboa (Risaralda) y Salamina (Caldas), en los años 2006, 2009, 2012 y 2015. Se determinaron las estadísticas con respecto a los factores de producción, edad, densidad, variedades, entre otros. Se analizó la información climática de las redes meteorológicas del Ideam y la Red Cafetera, para los elementos de temperatura y lluvia. Los valores de exceso y déficit hídrico e índice de humedad del suelo fueron derivados del cálculo de balance hídrico. Se evaluaron los cambios entre años y por etapas fisiológicas del cultivo. Se concluyó que, Salamina y Santuario disminuyeron su área cafetera entre 2009 y 2015, mientras Balboa la incrementó. Los factores de amenaza se relacionaron con las condiciones hídricas de exceso (Santuario y Salamina) y déficit (Balboa). En todos los municipios de este estudio la mayor vulnerabilidad se presenta en áreas por debajo de 1.300 m de altitud, en el escenario El Niño, 2015, relacionada con incremento de la temperatura y disminución de la oferta hídrica anual. La condición biofísica (clima y suelo) no estuvo asociada a la dinámica de cambio, en área y cultivos de café, en los municipios estudiados.